Thuật ngữ

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, thường kết hợp với 2,4-dinitrophenyl (Dnp) hoặc 3-nitro-tyrosine (NitroTyr) để tạo thành cặp Fluorophore/Quencher. kích thích ở bước sóng 320 nm, phát xạ ở bước sóng 420 nm.

3-Abz (axit m-aminobenzoic) có thể được xem là axit -amino. Khi axit m-aminobenzoic được kết hợp vào chuỗi peptide, nó sẽ tạo ra một vòng xoắn cứng.

4-Abz (axit p-Aminobenzoic, PABA), là dẫn xuất của axit benzoic tự nhiên, cũng có thể được sử dụng làm miếng đệm tuyến tính cứng.

Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), axit -aminobutyric, là một dẫn xuất của axit amin. Do cấu trúc tương tự với các axit amin tự nhiên nên nó thường được sử dụng trong thiết kế và tổng hợp các peptit và các chất bắt chước peptit.

Ac đại diện cho axetyl. Quá trình acetyl hóa đầu N là một biến đổi ổn định phổ biến đối với các peptide trong tự nhiên.

Acm, Acetamidometyl, có thể được loại bỏ bằng Hg(II) hoặc Ag(I). Đây là một trong những nhóm bảo vệ thiol thường được sử dụng cho cysteine ​​khi tổng hợp các peptide có nhiều liên kết disulfide.

ACTH (hormone adrenocorticotropic) là một loại hormone được tiết ra bởi tuyến yên trước, kích thích vỏ thượng thận sản xuất corticosteroid.

Aad (L- -axit aminoadipic) là một axit amin không tạo protein. Cấu trúc của nó tương tự như axit glutamic (Glam), với một nhóm methylene bổ sung trong chuỗi bên của nó.

Axit axetic (2-Aminoethoxy), còn được gọi là glycine ethyl ester hoặc glycine ethylamide, có thể được sử dụng làm chất đệm hoặc chất liên kết trong quá trình tổng hợp biến đổi peptit.

1-(1'-adamantyl)-1-methyl-ethoxycarbonyl, một nhóm bảo vệ amino rất bền với axit trong quá trình tổng hợp peptit, có thể bị mất khả năng bảo vệ bởi 3% TFA/CH2Cl2

AFC (7-Amino-4-trifluoromethylcoumarin) là một hợp chất huỳnh quang có sự kích thích coumarin được giải phóng ở 395-400 nm, phát xạ ở 495-505 nm.

Các loài có trọng lượng phân tử cao hơn được hình thành do sự bám dính không cộng hóa trị của các loài nhỏ hơn. Trong protein nói riêng, sự kết tụ là một dạng biến tính có thể xảy ra trên các bề mặt không phân cực với các cấu trúc thứ cấp, chẳng hạn như các cấu trúc thường hình thành các tương tác nội phân tử và được chôn trong các vòng xoắn và tấm - của protein. Các phân tử tương tác với nhau, đôi khi tạo thành dạng đa phân tử không hòa tan. Sự tổng hợp trái ngược với quá trình oligome hóa, sự tương tác bình thường của các protein tự nhiên được gấp lại chính xác để tạo thành các polyme bậc cao..

AHX, Aminohexanoyl,6-axit amino hexanoic, cũng được viết tắt là Aca hoặc LC, Thường được giới thiệu là chất đệm không phân cực ngắn giữa các chuỗi biotin, fluorophores và peptide.

2-Axit Aminoisobutyric là một axit amin không phải protein hiếm, là sản phẩm cuối cùng của quá trình chuyển hóa pyrimidine và được bài tiết qua nước tiểu và có trong một số loại kháng sinh có nguồn gốc từ nấm. Cũng được sử dụng để thay thế axit amin tự nhiên để tổng hợp peptide.

Rượu là những hợp chất hữu cơ được đặc trưng bởi sự có mặt của một, hai hoặc nhiều nhóm hydroxyl (−OH) liên kết với nguyên tử carbon trong nhóm alkyl hoặc chuỗi hydrocarbon. Rượu peptide là những hợp chất quan trọng về mặt lâm sàng chưa được nghiên cứu đầy đủ trong các nghiên cứu về mối quan hệ cấu trúc-hoạt động (SAR) để khám phá thuốc. Ví dụ, DAMGO là một chất chủ vận thụ thể opioid được biến đổi bởi rượu ở đầu C, với trình tự Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Nó có tính chọn lọc và ái lực cao với thụ thể μ-opioid.

Anđehit là một hợp chất hữu cơ trong đó nhóm cacbonyl được gắn vào một nguyên tử cacbon ở cuối chuỗi cacbon. Aldehit peptide là công cụ quan trọng trong sinh hóa và sinh học hóa học để ức chế và vô hiệu hóa protease.

Aloc - Allyloxycarbonyl, nhóm bảo vệ amino (còn viết tắt là Alloc). Bảo vệ có thể được loại bỏ bằng Pd(PPh3)4.

Bệnh Alzheimer, được đánh dấu bằng các mảng amyloid và các đám rối tau, là kết quả của rối loạn chức năng khớp thần kinh và các vấn đề về đường thanh thải, gây suy giảm nhận thức.

7-Amino-4-methylcoumarin (AMC) là chất dò huỳnh quang phổ biến để ghi nhãn peptit trong các nghiên cứu về protease. Sự liên hợp của nó với một peptide làm tắt tín hiệu huỳnh quang và AMC được giải phóng khi phân tách protease có thể định lượng hoạt động của enzyme, với cực đại kích thích/phát xạ là 345/445 nm. Ví dụ, peptit huỳnh quang cơ chất được ưu tiên dùng để xác định hoạt tính giống trypsin của proteasome đã tinh chế, có trình tự: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Peptide natriuretic tâm nhĩ (ANP), một loại hormone được sản xuất và giải phóng bởi tâm nhĩ của tim để đáp ứng với việc tăng thể tích và huyết áp. Nó có chức năng điều chỉnh cân bằng chất lỏng và huyết áp bằng cách thúc đẩy sự giãn mạch, tăng sản xuất nước tiểu (lợi tiểu) và giảm tái hấp thu natri ở thận. Những hành động này giúp chống lại tác động của huyết áp cao và tình trạng quá tải chất lỏng trong cơ thể.

Peptide kháng nguyên là các chuỗi axit amin ngắn có nguồn gốc từ protein hoặc các phân tử sinh học khác kích hoạt phản ứng miễn dịch của sinh vật. Những peptide này được hệ thống miễn dịch công nhận là lạ hoặc lạ đối với cơ thể, dẫn đến việc kích hoạt các tế bào miễn dịch như tế bào T và tế bào B. Các peptide kháng nguyên đóng một vai trò quan trọng trong các phản ứng miễn dịch, bao gồm sản xuất kháng thể thích ứng và phát triển trí nhớ miễn dịch. Chúng được nghiên cứu rộng rãi trong lĩnh vực miễn dịch học và phát triển vắc-xin vì khả năng kích hoạt các phản ứng miễn dịch cụ thể chống lại mầm bệnh hoặc tế bào bất thường.

Việc tổng hợp các peptide không đối xứng với 2, 4 và 8 nhánh có thể đạt được bằng cách chèn chiến lược lysine, arginine hoặc axit glutamic vào chuỗi peptide.

Dimethylarginine không đối xứng (ADMA, Arg(Me)2) là một hợp chất hóa học tự nhiên và là chất ức chế nội sinh của nitric oxit synthase (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (bất đối xứng) có thể được sử dụng trực tiếp để tổng hợp các peptide chứa dimethylarginine bất đối xứng.

5-Axit aminovaleric, có thể được sử dụng làm chất đệm hoặc chất liên kết trong quá trình tổng hợp biến đổi peptit.

Benzyloxymethyl (Bom) là nhóm bảo vệ imidazole không bền với axit được sử dụng trong quy trình Boc-SPPS cho các peptide chứa histidine. Benzyloxymethyl tạo ra formaldehyde có khả năng phản ứng cao sau khi xử lý bằng axit. Do đó, Bom được phân tách tốt nhất khi có mặt Cys, methoxyamine hoặc các hợp chất khác phản ứng với aldehyd.

-amino axit có nhóm amino gắn với -carbon, đây là nguyên tử carbon thứ hai cách xa nhóm carboxyl. Công thức cấu tạo chung của axit -amino có thể được biểu diễn dưới dạng: R−CH(NH2)−COOH

Peptide natriuretic loại B (BNP), một loại hormone được sản xuất chủ yếu bởi tâm thất của tim để đáp ứng với sự căng quá mức của các tế bào cơ tim. Nó đóng một vai trò quan trọng trong việc điều chỉnh huyết áp và cân bằng chất lỏng, chủ yếu bằng cách thúc đẩy sự giãn mạch và tăng bài tiết natri qua thận.

t-Butyloxycarbonyl (Boc) là nhóm bảo vệ axit-labilea-amino rất mạnh trong tổng hợp peptit, có thể phân cắt bằng TFA/methylene chloride (1:1), HCl trong etyl axetat hoặc dioxan, axit formic 98%.

2-(4-Biphenylyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) là nhóm bảo vệ axit-labilea -amino rất mạnh trong quá trình tổng hợp peptide, có thể được phân tách bằng 1% TFA/methylene chloride.

Các peptide có 2, 4 và 8 nhánh có thể đạt được bằng cách chèn lysine, arginine hoặc axit glutamic một cách chiến lược vào chuỗi peptide.

t-Butyldimethylsilyl (TBS hoặc TBDMS) là nhóm bảo vệ hydroxyl tương thích với Fmoc-SPPS. Nó không bền với axit và có thể bị phân cắt có chọn lọc bởi các ion florua.

Benzoyl là một nhóm acyl thường được giới thiệu ở đầu N của peptide. Nó ít phân cực hơn acetyl (Ac) và có thể biến đổi vĩnh viễn.

Benzyl (Bzl) dư lượng alkyl và nhóm bảo vệ chuỗi bên được sử dụng để chặn rượu (Ser, Thr, Hyp) trong quá trình tổng hợp peptit. nó có thể được phân cắt bằng axit mạnh hoặc quá trình hydro hóa xúc tác (ví dụ hydro/Pd).

Cholecystokinin (CCK) là một hormone peptide được sản xuất bởi niêm mạc của ruột trên và được tìm thấy trong hệ thống thần kinh trung ương. Nó kích thích sự co bóp của túi mật, giải phóng enzyme tuyến tụy và ảnh hưởng đến các quá trình tiêu hóa khác nhau.

Peptide liên quan đến gen Calcitonin (CGRP) là một 37-peptide axit amin liên quan đến calcitonin, amylin và adrenomedullin. Nó tồn tại ở hai dạng -CGRP (CGRP I) và -CGRP (CGRP II), với các hoạt động sinh học tương tự nhau. CGRP chủ yếu được tìm thấy trong các tế bào thần kinh cảm giác và trung ương, ảnh hưởng đến chức năng tim mạch, chuyển hóa canxi và trương lực mạch máu bào thai. Các thụ thể của nó được kết hợp với G-protein và kích hoạt adenylate cyclase, tương tác với các protein điều chỉnh hoạt động của thụ thể (RAMP) để đảm bảo tính đặc hiệu của phối tử và vận chuyển tế bào.

L-Cyclohexylalanine (Cha) là một chất tương tự axit amin không phân cực của phenylalanine, trong đó vòng thơm được thay thế bằng vòng cyclohexane. Sự thay thế này cho phép nghiên cứu vai trò của các axit amin thơm trong các tương tác như tương tác π-π bằng cách thay thế các gốc phenylalanine bằng Cha trong thí nghiệm.

L- -Cyclohexylglycine (Chg) là một axit amin không phân cực bị cản trở về mặt không gian. Nó phục vụ như một dược phẩm trung gian quan trọng và cũng được tìm thấy trong các sản phẩm tự nhiên.

Cholesterol được sản xuất tự nhiên bởi gan và các tế bào khác trong cơ thể, nhưng nó cũng có thể đến từ thực phẩm chúng ta ăn, đặc biệt là từ các sản phẩm động vật như thịt, gia cầm và các sản phẩm từ sữa đầy đủ chất béo. Cholesterol có thể liên kết với các peptide để cải thiện dược động học.

cis-Hydroxyproline, đồng phân lập thể của trans-hydroxyproline tự nhiên.

Citrulline hiện diện trong protein là kết quả của quá trình biến đổi enzym sau dịch mã của dư lượng arginine.

CMK là chất ức chế kinase RSK2 có hiệu lực tương tự nhưng độ ổn định hóa học kém hơn FMK.

Peptide natriuretic loại C (CNP) là một peptide của các tế bào nội mô mạch máu, được biết đến với tác dụng giãn mạch. Nó thể hiện sự tương đồng về cấu trúc và sinh lý với các peptide natriuretic tâm nhĩ và não (ANP và BNP).

L- -Cyclopentylglycyl (Cpg), là một axit amin không phân cực bị cản trở về mặt không gian.

Trong trình tự peptit, gốc duy nhất đó được nối với trình tự tuyến tính bằng nhóm amino của nó, để lại một nhóm carboxy tự do. Nhóm carboxyl của gốc này có thể trải qua các biến đổi như amit hóa hoặc, trong các trường hợp như pyroglutamate, lactam hóa nội bộ.

Cyanine 3 là thuốc nhuộm cyanine huỳnh quang màu đỏ thường được kích thích bởi nguồn sáng khoảng 558 nm và phát ra ánh sáng ở khoảng 572 nm.

Cyanine 5 là thuốc nhuộm cyanine fluorophore phát ra huỳnh quang cận hồng ngoại thường được kích thích bởi nguồn sáng khoảng 646 nm và phát ra ánh sáng ở khoảng 664 nm.

Axit L-, -Diaminobutyric là một axit ,ω-diamino, một chất tương tự ngắn hơn của ornithine (Orn) và lysine (Lys). Với sự bảo vệ thích hợp, các axit ,ω-diamino có thể được biến đổi có chọn lọc ở vị trí Nω của chúng hoặc được kết hợp để tạo ra các peptide hoặc dendrimer phân nhánh.

3-(Dimethylaminoazo)benzen-4-axit cacboxylic, là một nhiễm sắc thể liên kết với các nhóm amino được sử dụng trong các ứng dụng hóa sinh và sinh học phân tử như một chất khử trong quá trình truyền năng lượng cộng hưởng huỳnh quang (FRET), ví dụ như với EDANS. Kích thích DABCYL ở bước sóng 454 nm.

Dabsyl,4-dimethylaminobenzensulfonyl clorua, Một nhiễm sắc thể liên kết với các nhóm amino được sử dụng làm chất khử khi kết hợp, ví dụ như với EDANS. Kích thích Dabsyl ở bước sóng 436 nm.

4-Dimethylamino-1-naphthalene-sulfonyl, một chất fluorophor liên kết với các nhóm amino, kích thích ở bước sóng 342 nm, phát xạ ở bước sóng 562 nm.

Axit L-, -Diaminopropionic (Dap hoặc Dpr) là một axit ,ω-diamino, là một chất tương tự ngắn hơn của axit diaminobutyric (Dab), ornithine (Orn) và lysine (Lys). Các dẫn xuất được biến đổi của axit ,ω-diamino có thể được biến đổi có chọn lọc ở vị trí Nω của chúng hoặc được kết hợp để tạo ra các peptit hoặc dendrimer phân nhánh.

1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) là nhóm bảo vệ amino được sử dụng trong tổng hợp peptit. Nó có thể được phân cắt có chọn lọc bằng cách sử dụng 2% hydrazine hydrat trong dimethylformamide (DMF). Nω-Dde cho phép loại bỏ Dde cụ thể khỏi các axit amin như Dap, Dab, Orn hoặc Lys sau khi tổng hợp peptide pha rắn Fmoc (SPPS), tạo điều kiện biến đổi trên nhựa của nhóm Nω-amino.

Liên kết disulfide là liên kết cộng hóa trị được hình thành giữa hai nhóm sulfhydryl (-SH) của gốc cystein trong protein.

2,4-dimethoxybenzyl là nhóm bảo vệ formamide không bền với axit được sử dụng để biến đổi xương sống thuận nghịch trong quá trình tổng hợp peptit. Chúng được kết hợp trong quá trình tổng hợp peptide pha rắn (SPPS) dưới dạng axit amin hoặc dipeptide Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), trong đó Fmoc ngăn chặn sự kết tụ peptide và do đó thúc đẩy quá trình kéo dài hiệu quả. Dmb cũng thúc đẩy các phản ứng tạo vòng và ngăn ngừa sự hình thành asparagimide. Không giống như các dẫn xuất Hmb, Dmb không tạo thành benzoxazepin trong quá trình kích hoạt.

2,4-Dinitrophenyl là một nhiễm sắc thể được liên hợp với các nhóm amino, thường được sử dụng làm chất khử trong chất nền truyền năng lượng cộng hưởng huỳnh quang (FRET).

4,4′-Dimethoxydityl, còn được gọi là bis-(4-methoxyphenyl)methyl, là nhóm bảo vệ carboxamide không bền với axit tương thích với quá trình tổng hợp peptide pha rắn Fmoc (SPPS).

DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, là tiền chất của một số chất dẫn truyền thần kinh quan trọng, bao gồm dopamine, norepinephrine và epinephrine.

(4,7,10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-axit axetic, viết tắt là DOTA, là một chất tạo chelat tuần hoàn thường được gắn vào đầu N của peptit. DOTA tạo điều kiện thuận lợi cho việc dán nhãn peptide bằng các hạt nhân phóng xạ như 68Ga hoặc 90Y cho các ứng dụng y sinh khác nhau, bao gồm hình ảnh và liệu pháp nhắm mục tiêu.

Diphenylmethyl (dityl), một nhóm bảo vệ N-, O- và S không bền với axit.

Axit Diethylenetriaminepentaacetic (DTPA) là chất chelat hữu ích cho các hạt nhân phóng xạ như (68)Ga, (99m)Tc và (111)In, có thể áp dụng cho hình ảnh y học hạt nhân.

{{0}[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-axit sulfonic (EDANS) là một fluorophore thường được liên kết với Nω của axit diamino như lysine. Nó thường được sử dụng trong chất nền FRET, thường được kết hợp với các chất khử chất như DABCYL. EDANS có bước sóng kích thích 340 nm và phát ra ở bước sóng 490 nm.

Polypeptide kích hoạt bạch cầu đơn nhân nội mô.

Ethyl, một nhóm alkyl và chất tương đồng của methyl (Me), được sử dụng để biến đổi N- và S-ethyl hóa vĩnh viễn trong peptide.

Lập bản đồ epitope (ánh xạ epitope kháng nguyên) là một kỹ thuật được sử dụng để xác định các khu vực cụ thể (nghĩa là các epitope kháng nguyên) trên một kháng nguyên có thể được nhận biết bởi các kháng thể hoặc hệ thống miễn dịch. Các epitop kháng nguyên có thể được chia thành các epitop tuyến tính và các epitop hình dạng. Thông qua việc lập bản đồ kháng nguyên, chúng ta có thể hiểu sâu sắc mối quan hệ giữa cấu trúc và chức năng của kháng nguyên, điều này có ý nghĩa rất lớn trong việc phát triển vắc xin, chẩn đoán bệnh, liệu pháp miễn dịch và các khía cạnh khác.
Một số phương pháp lập bản đồ kháng nguyên thường được sử dụng bao gồm:
Tinh thể học tia X: Nó có thể phân tích trực tiếp cấu trúc ba chiều của kháng nguyên, từ đó xác định vị trí của epitope.
Cộng hưởng từ hạt nhân: Nó cũng có thể được sử dụng để phân tích cấu trúc của kháng nguyên để xác định epitope.
Kỹ thuật quét peptide: Sử dụng một loạt các đoạn peptide tổng hợp chồng lên nhau để xác định vị trí quyết định kháng nguyên liên kết với kháng thể.
Ví dụ, trong nghiên cứu và phát triển vắc xin, việc làm rõ các epitop chính của kháng nguyên giúp thiết kế vắc xin hiệu quả hơn và tạo ra phản ứng miễn dịch có mục tiêu hơn; trong chẩn đoán bệnh, việc xác định các epitope kháng nguyên liên quan đến các bệnh cụ thể có thể phát triển các thuốc thử chẩn đoán chính xác hơn.

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) là chất phát huỳnh quang thường được sử dụng để dán nhãn các phân tử sinh học, có bước sóng kích thích là 490 nm và phát xạ ở bước sóng 520 nm.

Fluorescein-6-carbonyl là chất fluorophore gắn với các nhóm amino, có bước sóng kích thích là 490 nm và phát xạ ở bước sóng 520 nm.

Fluorescein isothiocyanate (FITC) là một fluorophore phản ứng với các nhóm amino. Khi gắn thẻ một peptide ở đầu N của nó bằng FITC, một miếng đệm như -alanine hoặc Ahx thường được chèn vào. FITC có bước sóng kích thích 490 nm và phát xạ ở bước sóng 520 nm.

9-Fluorenylmethyl là nhóm bảo vệ bazơ không bền được sử dụng để bảo vệ O và S.

FMK, fluoromethyl ketone, là chất ức chế không thể đảo ngược của RSK2 kinase.

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), nhóm bảo vệ amino trong quá trình tổng hợp pha rắn FMOC, có thể được loại bỏ bằng 20% ​​piperidine/DMF.

Formyl là nhóm bảo vệ indole được sử dụng trong Boc-SPPS. Trp(For) bị phân cắt bởi HF khi có mặt mercaptan hoặc bởi các bazơ như piperidine.

Truyền năng lượng cộng hưởng huỳnh quang (FRET) là sự truyền năng lượng không bức xạ từ chất fluorophore bị kích thích (chất cho) sang chất nhận thích hợp (chất khử). Việc truyền tải phụ thuộc vào khoảng cách, hướng lưỡng cực và sự chồng chéo quang phổ của người cho và người nhận. Trong chất nền FRET, chất fluorophore và chất khử chất được liên kết thông qua chuỗi peptide. Sự phân cắt enzyme làm tăng huỳnh quang bằng cách tách chất cho và chất nhận.

Huỳnh quang là ánh sáng phát ra từ một chất hấp thụ ánh sáng hoặc bức xạ điện từ khác. Điều này xảy ra khi các phân tử gọi là fluorophores hấp thụ các photon có bước sóng cụ thể, bị kích thích, sau đó phát ra các photon và trở về trạng thái cơ bản. Ánh sáng phát ra thường có bước sóng dài hơn và năng lượng thấp hơn ánh sáng bị hấp thụ, dẫn đến phổ huỳnh quang đặc trưng. Hiện tượng này được sử dụng rộng rãi cho nhiều mục đích khoa học và y tế, bao gồm kính hiển vi, tế bào học dòng chảy và quang phổ huỳnh quang.

Polypeptide ức chế dạ dày (GIP), còn được gọi là peptide insulinotropic phụ thuộc glucose, thuộc họ hormone secretin. Nó kích thích bài tiết insulin, ức chế bài tiết axit dạ dày và đóng vai trò quan trọng trong việc điều hòa bài tiết insulin và cân bằng nội môi glucose.

L- -Axit carboxyglutamic (Gla) được hình thành thông qua quá trình carboxyl hóa sau dịch mã của axit glutamic, tạo ra các protein có khả năng liên kết các ion canxi, chẳng hạn như Osteocalcin. Các peptide chứa Gla được tổng hợp lý tưởng bằng cách sử dụng tổng hợp peptide pha rắn Fmoc (SPPS), vì Gla có thể trải qua quá trình khử carboxyl để tạo ra axit glutamic khi có axit mạnh.

Các peptide giống Glucagon là thành viên của siêu họ glucagon của các hormone peptide có nguồn gốc từ vùng đầu C của proglucagon. Chúng chủ yếu được tổng hợp bởi các tế bào L ở ruột.

Hormon giải phóng Gonadotropin (LHRH) là một hormone decapeptide được sản xuất trong các tế bào thần kinh vùng dưới đồi và được giải phóng theo từng đợt vào tuần hoàn cửa tuyến yên. Sự bài tiết theo nhịp đập rất quan trọng đối với các chức năng sinh sản, phát triển giới tính và sự biệt hóa.

Hormon giải phóng hormone tăng trưởng (GHRH), còn được gọi là somatorelin, là một hormone peptide vùng dưới đồi có tác dụng kích thích tuyến yên giải phóng và tổng hợp hormone tăng trưởng.

Hormon giải phóng hormone tăng trưởng (GHRH), còn được gọi là somatorelin, là một hormone peptide vùng dưới đồi có tác dụng kích thích tuyến yên giải phóng và tổng hợp hormone tăng trưởng.

Kháng nguyên bạch cầu ở người (HLA) đề cập đến một nhóm protein được tìm thấy trên bề mặt tế bào, đóng vai trò quan trọng trong việc hệ thống miễn dịch nhận biết các chất lạ. Chúng được mã hóa bởi các gen phức hợp tương hợp mô chính (MHC) ở người và rất cần thiết cho việc trình diện các kháng nguyên cho tế bào T, cho phép hệ thống miễn dịch phân biệt giữa tế bào của bản thân và tế bào không của bản thân. Các phân tử HLA rất đa dạng và đa hình, góp phần đáng kể vào phản ứng miễn dịch của từng cá nhân và tính nhạy cảm với các bệnh tự miễn và thải ghép.

2-hydroxy-4-methoxybenzyl là nhóm bảo vệ formamide không bền với axit được sử dụng để biến đổi xương sống thuận nghịch trong quá trình tổng hợp peptit. Nó được kết hợp dưới dạng axit amin hoặc dipeptide Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) trong quá trình tổng hợp peptide Fmoc pha rắn (SPPS), ngăn chặn sự kết tụ và cho phép mở rộng peptide hiệu quả. Hmb cũng hỗ trợ các phản ứng tạo vòng và ngăn ngừa sự hình thành asparagine.

L-Homoarginine là chất tương đồng của L-arginine, viết tắt là Har, và có thể được tìm thấy trong huyết tương và nước tiểu. Homoarginine là kết quả của quá trình guanid hóa lysine, quá trình này cũng có thể được thực hiện trên các peptide và protein.

Homocitrulline là một chất tương đồng của L-citrulline, viết tắt là Hci, và có thể được phát hiện trong nước tiểu của con người.

L-homocysteine ​​là một chất tương đồng của cysteine, viết tắt là Hcy, và được tạo ra bởi quá trình demethyl hóa methionine. Nồng độ Hcy trong máu tăng cao là yếu tố nguy cơ mắc các bệnh tim mạch và thoái hóa thần kinh. Ngược lại với các dẫn xuất Cys, các dẫn xuất Hcy không bị phân biệt chủng tộc trong quá trình ghép nối, cũng như -elimin.

Tương đồng của L-leucine, viết tắt là Hle.

Homophenylalanine, một chất tương đồng của phenylalanine, viết tắt là Hph, là một thành phần của thuốc ức chế ACE và renin. Fmoc-Homophe-OH là một loại thuốc chống viêm tiềm năng.

L-homoproline hoặc axit L-picolic, viết tắt là Pip hoặc Hpr. Chất tương đồng proline Hpr là sản phẩm thoái hóa của L-lysine. Cả hai chất đối kháng đều có thể được phát hiện trong huyết tương người. Vì dư lượng proline ảnh hưởng mạnh mẽ đến cấu trúc của peptit nên việc thay thế Pro bằng Hpr (hoặc axit azetidine-2-carboxylic (Aze)) có thể điều chỉnh cấu trúc bậc hai của nó.

L-transhydroxyproline được tạo ra sau dịch mã bằng quá trình oxy hóa proline. Hyp là thành phần chính của collagen và protein trai.

Isoserine, một đồng phân của L-serine, là một axit -amino.

ivDde, một nhóm bảo vệ amino, có thể bị mất bảo vệ và bị phân cắt bởi 2% hydrazine hydrat trong DMF. ivDde ổn định hơn Dde khi điều trị bằng piperidine thường xuyên trong Fmoc-SPPS. Nω-ivDde có thể được loại bỏ một cách có chọn lọc khỏi Dap, Dab Orn hoặc Lys, cho phép biến đổi nhóm Nω-amino sau tổng hợp trên nhựa.

Keyhole khập khiễng hemocyanin (KLH) là một metallicoprotein đa tiểu đơn vị vận chuyển oxy lớn được tìm thấy trong máu của hemocyanin khập khiễng lỗ khóa khổng lồ. Là chất mang kháng nguyên, KLH thường tăng cường khả năng sinh miễn dịch và khả năng cố định kháng nguyên bằng cách ghép các chuỗi polypeptide mục tiêu, thúc đẩy đáng kể việc tạo ra các kháng thể hiệu quả, đặc hiệu và chức năng.

Hormon giải phóng hormone luteinizing (LHRH hoặc GnRH) là một loại hormone decapeptide được tổng hợp bởi các tế bào thần kinh tiết trong vùng dưới đồi và được giải phóng theo nhịp vào vòng tuần hoàn của tuyến yên. Sự bài tiết theo nhịp đập rất quan trọng đối với chức năng sinh sản, phát triển giới tính và sự biệt hóa.

Trong thiết kế và tổng hợp peptit, người nghiên cứu có thể chèn một trình liên kết giữa biotin hoặc huỳnh quang và peptit. Chất đệm kỵ nước phổ biến là axit aminohexanoic (Ahx), và chất đệm ưa nước phổ biến là poly(ethylene) glycol (PEG).

Quá trình đông khô, loại bỏ chất lỏng khỏi vật liệu nhạy cảm với nhiệt. Vật liệu được đông lạnh, đặt trong chân không cao và giữ ở nhiệt độ thấp. Áp suất do chân không tạo ra làm cho băng chuyển từ trạng thái rắn sang khí mà không chuyển qua trạng thái lỏng. Peptide thường được phân phối dưới dạng bột đông khô.

Sắc ký lỏng-Khối phổ là một kỹ thuật phân tích linh hoạt tích hợp sắc ký lỏng với phép đo phổ khối để cung cấp thông tin chi tiết về thành phần và cấu trúc của các phân tử trong các mẫu phức tạp.

Nhiều peptide kháng nguyên. Nhiều Peptide kháng nguyên là một cách hiệu quả để tạo ra các kháng thể kháng peptide hiệu giá cao và vắc xin peptide tổng hợp.

Phương pháp quang phổ khối ion hóa/khử hấp thụ bằng laser được hỗ trợ bởi ma trận (MALDI-MS) là một kỹ thuật phân tích được sử dụng để đo tỷ lệ khối lượng trên điện tích của các ion. Nó đặc biệt hữu ích cho việc phân tích các phân tử sinh học như peptide, protein và polyme.

Phép đo khối phổ (MS) là một kỹ thuật phân tích mạnh mẽ được sử dụng để đo tỷ lệ khối lượng trên điện tích (m/z) của các ion.

4-Methoxy- -naphthylamide, viết tắt là MNA, là một chất fluorophore thường được gắn vào chất nền carboxypeptidase ở đầu C. Tách 4M NA kích thích ở 335-350 nm và phát ra ở 410-440 nm

Methoxybenzensulfonyl (Mbs) là nhóm bảo vệ guanidyl được sử dụng trong tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS). Nhóm bảo vệ này có thể bị mất bảo vệ bằng cách phân cắt bằng hydro florua (HF).

4-Methylbenzyl (Mbzl) là nhóm bảo vệ sulfhydryl được sử dụng trong quá trình tổng hợp peptit pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS). Mbzl ổn định hơn methoxybenzyl (Mob) khi xử lý bằng axit trifluoroacetic (TFA) thường xuyên và có thể được loại bỏ bằng cách phân tách hydro florua (HF).

(7-Methoxycoumarin-4-yl)axit axetic (Mca) là một chất fluorophore có thể liên kết với một nhóm amino.
Mca liên kết với dinitrophenyl (Dnp) để làm chất nền truyền năng lượng cộng hưởng huỳnh quang (FRET). Bước sóng kích thích là 325 nm và bước sóng phát xạ là 392 nm.

Hormon tập trung melanin (MCH) là một peptide thần kinh tuần hoàn lần đầu tiên được phân lập từ cá và chuột. MCH chủ yếu liên quan đến việc điều chỉnh sắc tố da ở cá teleost và hành vi kiếm ăn ở động vật có vú.

Methyl, nhóm thế alkyl đơn giản nhất, tham gia vào quá trình methyl hóa N-, O- và S, tạo thành những biến đổi vĩnh viễn của peptide.

3-Methoxysuccinyl, tương ứng với Asp(OMe) đã khử amin, là nhóm chặn đầu N có cực thường được kết hợp vào cơ chất carboxypeptidase.

Quá trình methyl hóa là một quá trình biến đổi sau dịch mã (PTM) của các peptide và protein trong đó nhóm methyl (-CH3) được thêm enzyme vào các gốc axit amin cụ thể, thường là lysine (Lys), arginine (Arg), histidine (His) hoặc glutamate ( Glam). Sự sửa đổi này có thể ảnh hưởng đáng kể đến chức năng, tính ổn định và tương tác của protein với các phân tử khác, do đó đóng vai trò then chốt trong việc điều chỉnh các quá trình tế bào khác nhau bao gồm biểu hiện gen, truyền tín hiệu và tương tác protein-protein.

Phức hợp tương hợp mô chính (MHC) là vùng di truyền chứa các gen mã hóa các phân tử MHC. Những phân tử này đóng một vai trò quan trọng trong hệ thống miễn dịch và khả năng tự miễn dịch. Ở người, phức hợp này còn được gọi là hệ thống kháng nguyên bạch cầu ở người (HLA).

Các phân tử MHC lớp I (MHC I) là các protein trên bề mặt tế bào trình diện các peptide từ bên trong tế bào đến tế bào T gây độc tế bào. Điều này giúp các tế bào miễn dịch nhận biết và tiêu diệt các tế bào bị nhiễm bệnh hoặc bất thường, rất quan trọng để bảo vệ miễn dịch chống lại mầm bệnh và ung thư.

Các phân tử MHC lớp II (MHC II) là các protein bề mặt tế bào trình diện các peptide có nguồn gốc từ các chất lạ cho tế bào T trợ giúp. Sự tương tác này rất cần thiết để điều phối các phản ứng miễn dịch và kích hoạt các tế bào miễn dịch khác chống lại mầm bệnh.

Monomethylated arginine (MMA) là một biến đổi sau dịch mã trong đó một nhóm methyl (-CH3) được thêm enzyme vào nitơ guanidino của dư lượng arginine trong peptide hoặc protein

3-mercaptopropylamine, có thể được sử dụng làm phối tử peptit hoặc chất biến tính trong các ứng dụng sinh hóa và y sinh khác nhau.

Myristoylation là một quá trình biến đổi lipid trong đó nhóm myristoyl, bao gồm một 14-axit béo bão hòa carbon, được liên kết cộng hóa trị với đầu N của peptit. Sự sửa đổi này nhằm mục đích neo protein vào màng tế bào, tạo điều kiện thuận lợi cho việc định vị và tham gia của nó vào các quá trình tế bào khác nhau.

-(1-naphthyl)-L-alanine là một dẫn xuất axit amin không phân cực tương tự như phenylalanine, nhưng có nhóm naphthyl thay vì nhóm phenyl.

-(2-Naphthyl)alanine là một dẫn xuất axit amin không phân cực tương tự như phenylalanine, nhưng có nhóm naphthyl thay vì nhóm phenyl.

3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazole (NBD) thường được đưa vào bằng cách liên hợp thuốc thử NBD-Cl với peptit. Các peptide có nhãn NBD được lựa chọn rộng rãi vì tiện ích của chúng trong các nghiên cứu tập trung vào màng và sinh học tế bào.

N-Ethylamide có thể được coi là một dạng alanine đầu C được khử carboxyl. Trong chất chủ vận LHRH buserelin, NHEt đóng vai trò như một chất tương tự của glycinamide đầu C. Peptide N-ethylamide có khả năng chống lại sự phân hủy của carboxypeptidase.

L-norleucine (Nle) là một đồng vị ổn định của L-methionine. Khi hoạt động sinh học của peptide bị tổn hại do sự hình thành sulfoxide, Nle có thể được thay thế cho Met mà không làm thay đổi đặc tính chức năng của nó.

NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-axit triacetic, là một chất thải chelat hai chức năng đóng vai trò như một khung để xây dựng các công cụ chụp ảnh PET. Nó cũng được sử dụng trong thiết kế đầu dò và khuếch đại tín hiệu thông qua các hiệu ứng đa hóa trị và có các ứng dụng tiềm năng như một dược phẩm phóng xạ gali chẩn đoán.

N-Me thường đề cập đến N-methyl hóa, một biến đổi hóa học trong đó nhóm methyl (-CH 3) được gắn vào một nguyên tử nitơ trong phân tử, chẳng hạn như N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, v.v.

NODAGA,1,4,7-triazacyclononane,1-axit glutaric-4,7-axit diacetic, là chất tạo chelat hai chức năng vượt trội để thiết kế và phát triển các dược phẩm phóng xạ hữu cơ kim loại, mang lại những lợi ích đáng kể tiềm năng ứng dụng trong chẩn đoán hình ảnh và xạ trị đích.

2-Nitrophenylthio (Nps) là nhóm bảo vệ S được sử dụng trong quá trình tổng hợp peptit pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS). Nó có thể bị phân cắt bởi thiol, đặc biệt là thông qua nhóm sulfhydryl tự do của cysteine ​​(Cys), dẫn đến sự hình thành đồng thời liên kết disulfide.

Neuropeptide Y (NPY) là một peptide thần kinh nổi bật trong não và là một phần của họ Neuropeptide Y, bao gồm polypeptide tuyến tụy (PP) và peptide YY (PYY).

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) là nhóm bảo vệ S tương thích với quá trình tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS). Npys có thể bị phân cắt bởi thiol, đặc biệt là thông qua nhóm sulfhydryl tự do của cysteine ​​(Cys), dẫn đến sự hình thành đồng thời liên kết disulfide.

Norvaline là một axit amin béo không phân cực và là chất tương đồng của axit -aminobutyric (Abu).

-Naphthylamide là một fluorophore thường được sử dụng trong cơ chất carboxypeptidase, thường được liên kết ở đầu C của peptide. NA bị cắt kích thích ở bước sóng 330 nm và phát ra ở bước sóng 370 nm.

-Naphthylamide là một fluorophore thường được sử dụng trong cơ chất carboxypeptidase, thường được liên kết ở đầu C của peptide. NA bị phân cắt ở 320-340 nm, phát xạ ở 410-420 nm.

Allyl ester là một nhóm bảo vệ carboxyl tương thích với cả quá trình tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Fmoc và Boc (SPPS). Tương tự như Aloc, este allyl có thể được loại bỏ một cách chọn lọc bằng cách xử lý bằng Pd(PPh3)4. Trong Fmoc-SPPS, Asp(OAll) dễ bị hình thành aspartimide với xúc tác bazơ.

Benzyl ester, một nhóm bảo vệ cacboxyl, có thể được loại bỏ bằng quá trình hydro hóa xúc tác (ví dụ H2/Pd) hoặc axit mạnh.

OcHex là nhóm bảo vệ carboxyl tiêu chuẩn được sử dụng trong quá trình tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS).

4-(N-[1(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-ethylbutyl]amino)benzyl ester (ODmab) là chất bảo vệ carboxyl nhóm được sử dụng trong tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Fmoc (Fmoc-SPPS). Nó có thể được phân tách và khử bảo vệ bằng cách sử dụng 2% hyđrazin hydrat trong DMF.

2,4-Dimethoxybenzyl ester là nhóm bảo vệ carboxyl có tính axit cao, có thể loại bỏ bằng cách sử dụng 1% TFA trong dichloromethane.

Ethyl ester, Do các điều kiện nghiêm ngặt cần thiết để loại bỏ este ethyl, việc biến đổi peptide bằng este ethyl có thể tăng cường tính ưa ẩm và tính ổn định của chúng.

9-Fluorenylmethyl ester là nhóm bảo vệ cacboxyl không bền bazơ có thể được loại bỏ bằng cách sử dụng piperidine trong DMF.

Este hexyl, Do các điều kiện nghiêm ngặt cần thiết để loại bỏ este etyl, việc biến đổi peptide bằng este etyl có thể tăng cường tính ưa mỡ và tính ổn định của chúng.

L-Otahydroindole-2-axit cacboxylic (Oic) là một axit amin bị cản trở không phân cực. Việc đưa axit amin liên quan đến proline này vào chuỗi polypeptide sẽ ảnh hưởng mạnh mẽ đến cấu trúc của peptide.

Methyl este là nhóm bảo vệ đầu C bán cố định trong quá trình tổng hợp pha lỏng và chúng có thể được chuyển đổi thành peptide hydrazide, tiền chất của peptide peptide phản ứng. Ghép azide vẫn là phương pháp ghép đoạn phổ biến nhất trong tổng hợp peptide pha lỏng.

3-Methylpent-3-yl este (OMpe) là nhóm bảo vệ cacboxyl không bền với axit thường được sử dụng để bảo vệ nhóm cacboxyl của axit aspartic (Asp) trong quá trình tổng hợp peptit pha rắn dựa trên Fmoc (Fmoc-SPPS ).Chất tương tự tert-butyl ester đòi hỏi khắt khe hơn này được phát triển đặc biệt để giảm sự hình thành asparagimide được xúc tác bazơ.

Các este ortho-nitrophenyl của axit Boc- hoặc Z-amino là các dẫn xuất được kích hoạt trước được sử dụng trong tổng hợp dung dịch peptide.

Ornithine (Orn) được tạo ra từ arginine trong chu trình urê và cũng có thể được quan sát thấy trong peptide dưới dạng sản phẩm thoái hóa arginine. Sự hình thành orn thông qua quá trình acyl hóa nửa guanidine của arginine là một phản ứng phụ phổ biến trong quá trình tổng hợp peptide.

Hydroxysuccinimide ester (OSu, viết tắt là NHS) là một dẫn xuất axit amin được tiền hoạt hóa thường được sử dụng trong tổng hợp peptide, đặc biệt là biến đổi peptide. Este OSu an toàn, không vô trùng, tương thích với hệ thống nước và dễ xử lý.

Tert-butyl ester, một nhóm bảo vệ carboxyl không bền với axit đối với các axit amin trong quá trình tổng hợp peptide.

4-axit aminobenzoic (axit para-aminobenzoic), Có thể được sử dụng để tổng hợp các chất liên kết liên hợp kháng thể-thuốc. Ví dụ: Mal-PEG2-Val-Cit-PABA là một trình liên kết liên hợp thuốc kháng thể (ADC) có thể phân tách.

PABC (para-aminobenzyl carbamate) là một hợp chất hóa học được sử dụng trong quá trình tổng hợp liên hợp kháng thể-thuốc (ADC) làm chất liên kết. Nó tạo điều kiện cho việc gắn thuốc vào kháng thể một cách có kiểm soát, cho phép phân phối thuốc theo mục tiêu trong các liệu pháp điều trị ung thư và các ứng dụng y sinh khác. Ví dụ, Mc-Val-Cit-PABC-PNP là một trình liên kết có thể phân tách bằng cathepsin được sử dụng trong liên hợp kháng thể-thuốc (ADC).

Polypeptide kích hoạt adenylate cyclase tuyến yên (PACAP) là một peptide thần kinh được bảo tồn cao, được biểu hiện nổi bật trong não động vật có vú. Nó phát huy tác dụng sinh học bằng cách tăng cường mức AMP tuần hoàn nội bào thông qua tương tác thụ thể.

Palmitoyl, một nhóm acyl không phân cực được đưa vào ở đầu N hoặc phía bên. Palmitoylation cũng đã được quan sát như một sự biến đổi sau dịch mã của protein.

Nhựa methyl phenyllacetamide là một loại nhựa được thiết kế đặc biệt để tổng hợp peptide pha rắn dựa trên Boc (Boc-SPPS). Các peptide được tổng hợp trên loại nhựa này có thể được giải phóng bằng cách phân tách HF.

Trong Liên hợp kháng thể-thuốc (ADC), trình liên kết kết nối kháng thể với tải trọng gây độc tế bào. Việc lựa chọn tải trọng là rất quan trọng vì nó quyết định tính hiệu quả và tính đặc hiệu của ADC trong việc cung cấp liệu pháp đến các mô đích thông qua các cơ chế giải phóng cụ thể.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) là nhóm bảo vệ guanidino được ưu tiên sử dụng trong quá trình tổng hợp peptit pha rắn dựa trên Fmoc (Fmoc-SPPS). Nó thể hiện khả năng chịu axit cao hơn một chút so với Pmc.

Penicillamine là một chất tương tự của L-cysteine ​​được đặc trưng bởi sự thay thế nhóm methyl (-CH3) bằng axit cacboxylic (-COOH).

Tự lắp ráp peptide là khi các peptide tự sắp xếp một cách tự nhiên thành các cấu trúc có trật tự mà không cần sự can thiệp từ bên ngoài. quá trình này được thúc đẩy bởi các tương tác không cộng hóa trị như liên kết hydro, tương tác kỵ nước, lực tĩnh điện và xếp chồng π-π. Khả năng tự lắp ráp peptide có thể dẫn đến sự hình thành các cấu trúc nano khác nhau bao gồm sợi, hình cầu, tấm và gel, có ứng dụng trong khoa học vật liệu, công nghệ sinh học và y học.

Phenylacetyl (Phenylac hoặc Phac) là một nhóm acyl thường được liên kết ở đầu N của peptide, có đặc điểm là độ phân cực thấp hơn so với acetyl (Ac). Nó tạo thành một sửa đổi vĩnh viễn của peptide.

phenylglycine (Phg) là một dẫn xuất axit amin trong đó nhóm phenyl thay thế nguyên tử hydro trong phân tử glycine

Peptide Histidine Isoleucine (PHI), một peptide của lợn có liên quan đến VIP và secretin.

Peptide histidine methionine (PHM), một peptide của con người có liên quan đến VIP.

Điểm đẳng điện (pI) được định nghĩa là mức độ pH mà tại đó protein/peptide có điện tích ròng bằng 0 (Smoluch et al., 2016).

2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonyl (Pmc) là nhóm bảo vệ guanidinyl thường được sử dụng trong quá trình tổng hợp peptit pha rắn dựa trên Fmoc (Fmoc-SPPS). Nó được ghi nhận là ít bền với axit hơn so với Pbf.

p-Nitroaniline, một nhiễm sắc thể, thường được liên hợp với đầu C của cơ chất carboxypeptidase. Độ hấp thụ của p-nitroaniline được giải phóng thường được đo ở bước sóng khoảng 405 hoặc 410 nm.

L-Propargylglycine (Pra) được sản xuất bởi vi sinh vật. Axit amin này, được đặc trưng bởi cấu trúc liên kết ba, được đánh giá cao như một đơn vị cơ bản để tổng hợp các peptide có khả năng tham gia vào các phản ứng "nhấp chuột hóa học", thu hút được sự chú ý đáng kể trong lĩnh vực này.

Hormon tuyến cận giáp (PTH) là một hormone peptide do tuyến cận giáp tiết ra, rất quan trọng để duy trì cân bằng nội môi canxi và phốt pho trong dịch ngoại bào.

Các sửa đổi sau dịch mã (PTM) của protein thêm các nhóm chức năng hoặc protein, cắt các tiểu đơn vị điều hòa hoặc phá vỡ toàn bộ protein. Những thay đổi này, như quá trình phosphoryl hóa, glycosyl hóa, methyl hóa, acetyl hóa, lipid hóa, phổ biến hóa, nitrosyl hóa và phân giải protein, ảnh hưởng đến cách tế bào hoạt động bình thường và trong khi mắc bệnh. Hiểu PTM là rất quan trọng cho nghiên cứu cơ bản và tìm ra phương pháp điều trị mới.

Axit pyroglutamic, còn được gọi bằng các chữ viết tắt như Pgl, Glp, pGlu, hoặc

phenylazobenzylmethoxycarbonyl là nhóm bảo vệ N mang màu được sử dụng trong tổng hợp peptide, có thể phân tách bằng quá trình hydro hóa xúc tác hoặc axit mạnh. Nó thể hiện bước sóng hấp thụ tối đa ở 229 nm, 320 nm và 441 nm.

Cặp chất khử bao gồm một phân tử huỳnh quang (fluorophore) và một phân tử chất khử chất được sử dụng trong nghiên cứu và thử nghiệm dựa trên huỳnh quang. Chất khử chất hấp thụ ánh sáng phát ra từ fluorophore, làm giảm huỳnh quang của nó. Khi fluorophore và chất khử được tách ra, chẳng hạn như thông qua phản ứng sinh hóa, tín hiệu huỳnh quang sẽ tăng lên. Điều này cho phép các nhà nghiên cứu đo lường những thay đổi và tương tác theo thời gian thực. Kỹ thuật này thường được sử dụng trong các ứng dụng như PCR thời gian thực, đầu dò phân tử và xét nghiệm FRET (Truyền năng lượng cộng hưởng Forster).

Fluorine-18 là phối tử phóng xạ thường được sử dụng trong chụp ảnh PET để đánh giá quá trình chuyển hóa glucose trong các mô và thường được sử dụng trong chẩn đoán ung thư và chụp ảnh não.

Thư viện peptide ngẫu nhiên là tập hợp nhiều chuỗi peptide ngắn được tạo ngẫu nhiên. Mỗi peptide trong thư viện có một số lượng axit amin cụ thể với trình tự được xác định ngẫu nhiên, tạo ra nhiều phân tử peptide đa dạng. Các nhà nghiên cứu sử dụng các thư viện này để sàng lọc các peptide có đặc tính, hoạt động sinh học hoặc tương tác cụ thể với các phân tử mục tiêu. Chúng đặc biệt hữu ích trong việc khám phá thuốc, miễn dịch học và nghiên cứu về tương tác protein-protein, giúp xác định phương pháp trị liệu mới và hiểu các quá trình sinh học phức tạp.

Dư lượng là một axit amin riêng lẻ trong peptide hoặc protein. Khi các axit amin kết hợp với nhau thông qua liên kết peptide để tạo thành các chuỗi này, mỗi đơn vị axit amin được gọi là dư lượng. Thuật ngữ này được sử dụng vì trong quá trình hình thành liên kết peptide, mỗi axit amin mất đi một phân tử nước (H2O), để lại thứ được gọi là dư lượng.

Nhựa là một loại polymer không hòa tan được sử dụng trong tổng hợp peptide pha rắn (SPPS) như một chất hỗ trợ vững chắc cho việc bổ sung liên tục các axit amin. Các hạt nhựa cung cấp một bề mặt ổn định và trơ để các axit amin ban đầu được liên kết cộng hóa trị, cho phép chuỗi peptide được tạo thành từng phần một.

Rhodamine B là thuốc nhuộm màu hồng sáng đến đỏ có bước sóng kích thích thường vào khoảng 540-570 nm và phạm vi ánh sáng phát ra là 560-580 nm. Nó thường được liên hợp với chuỗi peptide thông qua nhóm amino đầu N của peptide

Máy sắc ký lỏng hiệu năng cao pha đảo.

Thuốc có mối quan hệ cấu trúc-hoạt động (SAR) được phát triển bằng cách nghiên cứu mối quan hệ giữa cấu trúc hóa học của thuốc và hoạt động sinh học của nó.

Sarcosine, axit amin N-alkylat đơn giản nhất.

Dimethylarginine đối xứng(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (đối xứng) có thể được sử dụng trực tiếp để tổng hợp các peptide chứa dimethylarginine đối xứng.

Tổng hợp peptide pha rắn (SPPS) là một phương pháp tổng hợp hóa học các peptide, trong đó các peptide được lắp ráp từng bước trên chất hỗ trợ rắn hoặc nhựa bằng cách thêm tuần tự các axit amin được bảo vệ. SPPS bao gồm hai chiến lược: Fmoc-SPPS và Boc-SPPS, khác nhau ở việc lựa chọn nhóm bảo vệ nhóm N -amino (Fmoc hoặc Boc) và nhóm bảo vệ chuỗi bên. Loại nhóm bảo vệ N -amino được chọn quyết định chiến lược bảo vệ chuỗi bên và các điều kiện để phân tách cuối cùng peptide khỏi nhựa.

Statine, viết tắt là Sta, là một axit amin không phải protein thường được sử dụng trong thiết kế các chất bắt chước peptide, đặc biệt là trong quá trình tổng hợp các chất ức chế protease.

Tert-Butylthio (StBu) là nhóm bảo vệ S được phân cắt bằng cách khử phosphine và tương thích với Boc-SPPS.

Succinyl là một biến thể đầu N có cực tương ứng với aspartate đã khử amin và thường được tích hợp vào cơ chất carboxypeptidase.

TAMRA, còn được viết tắt là TMR, là một chất fluorophore có thể gắn vào một nhóm amino. Nó thường được sử dụng kết hợp với FAM cho chất nền FRET. TAMRA có bước sóng kích thích 485 nm và bước sóng phát xạ 535 nm.

Tert-butyl là nhóm bảo vệ không bền với axit thường được sử dụng cho rượu và phenol, có thể được phân tách bằng axit trifluoroacetic (TFA).

Triethylammonium phosphate là chất đệm được sử dụng trong pha động HPLC pha đảo.

Axit trifluoroacetic (TFA) đã được sử dụng để phân tách peptide khỏi nhựa trong Fmoc-SPPS và để loại bỏ các nhóm bảo vệ có nguồn gốc từ tBu.

Axit trifluoromethanesulfonic (TFMSA) là axit mạnh hơn TFA. TFMSA có thể được sử dụng như một giải pháp thay thế an toàn hơn cho HF có độc tính cao cho bước phân tách cuối cùng của chiến lược Boc-SPPS.

L-tert-leucine (Tle) là một axit amin không phân cực có chuỗi bên đòi hỏi khắt khe về mặt không gian làm mất ổn định các chuỗi xoắn ốc.

2,4,6-Trimethoxybenzyl là nhóm bảo vệ Asn và Gln amide không bền với axit được sử dụng trong Fmoc-SPPS.

Tosyl được sử dụng làm nhóm bảo vệ guanidine và imidazole trong Boc-SPPS và có thể bị loại bỏ bởi Na/NH3

Trityl (Trt) là nhóm bảo vệ không bền với axit được sử dụng cho các gốc Asn, Cys, Gln và His trong Fmoc-SPPS. Nó có thể được loại bỏ một cách có chọn lọc bằng cách sử dụng axit trifluoroacetic (TFA).

Các peptide tinh khiết thường tồn tại ở trạng thái bột màu trắng sau khi đông khô.

Peptide hoạt tính đường ruột (VIP) là một 28-peptide axit amin thuộc siêu họ peptide glucagon-ghrelin-secretin.

9-Xanthydryl (Xan) là nhóm bảo vệ amit không bền với axit được sử dụng cho các gốc Asn và Gln trong Boc-SPPS. Xan có thể được loại bỏ có chọn lọc bằng TFA.

Khi peptide được dán nhãn FAM fluorescein, bột đông khô thường có màu vàng.

Z-benzyloxycarbonyl, viết tắt là Z hoặc Cbz, được sử dụng làm nhóm bảo vệ amino trong quá trình tổng hợp peptide. Nó có thể được loại bỏ bằng cách thủy phân hoặc axit mạnh như HF hoặc axit HBr/axetic nguyên chất.